疯狂动物园的隐藏动物种类繁多，分布在草原、丛林、山脉、澳洲、极地和侏罗纪公园等不同区域。草原地图的隐藏动物包括暗黑野牛、特洛伊斑马、油炸狮和机械秃鹰。暗黑野牛需要骑同一只野牛跑700-800米不换乘；特洛伊斑马要求连续换乘7种不同的草原动物；油炸狮需用同一只狮子连续吃掉30个动物；机械秃鹰则出现在1400米后的大石头上，需借助长颈鹿或大象的狂暴状态触发。这些动物的出现条件与区域特性紧密相关，掌握基础操作是解锁的前提。
丛林区域的隐藏动物以鸭嘴河马、恐龙犀牛和三嘴鸟为代表。鸭嘴河马需骑同一只河马在水中前进1600米，建议在2000米后水域较多的区域完成；恐龙犀牛要求连续换乘7种丛林动物；三嘴鸟的触发条件较为特殊，需要从巨嘴鸟身上完成100米跳跃并安全换乘到其他动物。山脉区域的苏-24战斗熊需骑老鹰飞行2000米不换乘；蒸汽朋克牦牛要通过撞击10只动物解锁；纯黑鹿则需连续换乘8种不同动物，其中需包含7种山脉动物和1种外来动物。
澳洲和极地区域的隐藏动物设计更具特色。澳洲的炸弹袋熊需要一次撞击4只动物，变色骆驼则要连续换乘8种动物；极地的仙女企鹅同样需要连续换乘8种动物，但必须包含7种极地动物。侏罗纪公园区域的海怪甲龙需用甲龙撞倒霸王龙，健身霸王龙要求收集五个随机出现的恐龙蛋，潜水雷龙则需连续骑乘8种不同动物。这些隐藏动物的触发机制往往结合了区域地形特征与动物行为模式。
部分隐藏动物的出现具有时间或天气限制。雄鸡鳄仅在上午时段出现概率较高，幽灵企鹅需要将设备时间调整为冬季才能触发。天气变化也会影响特定动物的出现，雪豹只在下雪天现身，电鳗则需等待雷雨天气。这类时间敏感性动物需要玩家注意游戏内环境变化，合理安排捕捉时机。随机事件如破坏风车、收集恐龙蛋等任务也会影响部分隐藏动物的出现概率。
隐藏动物的抓捕技巧主要围绕三个核心要素：动物特性理解、地形利用和操作稳定性。长距离骑乘类任务建议携带加速类宝宝提升效率；连续换乘任务需提前规划路线，确保目标动物分布密集；撞击类任务则要选择开阔区域避免中断。利用动物狂暴状态的特殊能力是完成高难度任务的关键，如大象狂暴可破坏大型障碍，老鹰飞行能跨越复杂地形。复活机制允许部分任务进度保留，合理使用可降低挑战难度。
完成隐藏任务获得的动物不仅能丰富动物园收藏，还会解锁特殊成就。每只隐藏动物都有独特的展示效果和游客吸引力加成，部分还能提供游戏内的实用功能。系统记录已解锁动物和待完成任务的功能有助于玩家规划收集进度。隐藏动物系统的设计体现了游戏对探索精神的鼓励，通过逐步掌握各区域动物的出现规律，玩家能够体验到持续发现的乐趣。
